При необходимости в будущем вернуться к Linux лучше скопировать файлы конфигурации, которые вы изменяли в процессе работы с Linux. Обратите внимание, что имеющиеся до удаления файлы типа /etc/fstab впоследствии вряд ли можно будет применять, так как не исключено, что к тому моменту изменится таблица разделов. Если вы осуществляли пересборку ядра операционной системы, скопируйте его и модули (если до повторной установки Linux вы не измените конфигурацию компьютера, это ядро еще понадобится).
Очередная большая проблема, которая будет подстерегать вас при удалении Linux, – это загрузчик. При удалении Linux вы наверняка захотите удалить раздел, в котором стояла эта операционная система, и загрузчик. Если вы устанавливали загрузчик GRUB или LILO, перед удалением разделов необходимо выполнить некоторые операции по переносу файлов установленного загрузчика в другой раздел или восстановить старый загрузчик.